上海代理记账公司的收费标准通常基于企业的规模、业务复杂程度以及所需服务的种类而定。一般来说，代理记账公司的收费方式主要分为以下几种：
1. 固定收费：根据企业的注册类型、月度交易量以及服务内容制定固定费用，一般适用于小型企业或者业务比较简单的企业。固定收费的好处是稳定，企业可以在预算内安心使用服务。
2. 按时收费：根据代理记账公司为企业提供的服务时间计费，例如每小时、每日或每月收费，费用根据服务时间的长短而定。这种收费方式适用于一些中小型企业，根据实际需要灵活调整服务时间。
3. 按交易量收费：根据企业每月的交易量来确定收费金额，交易量越大，收费金额越高。这种收费方式适用于交易量较大的企业，能够更准确地反映代理记账公司的工作量。
4. 综合收费：将固定费用、按时费用和按交易量费用相结合，根据企业的实际情况综合计算收费金额。这种收费方式能够更全面地考虑到企业的需求和代理记账公司提供的服务。
无论采用哪种收费方式，企业在选择代理记账公司时都应该注意服务的内容、质量以及是否符合自身需求，同时要与代理记账公司进行充分沟通，了解清楚收费标准和服务内容，以避免后期出现纠纷或者不必要的费用支出。